La saison 2019/2020 de Metz Handball restera comme une année inédite, brutalement interrompue par la pandémie de Covid-19 alors que le club réalisait un parcours sportif irréprochable sur tous les tableaux. Sur le plan national, la toute première édition de la Ligue Butagaz Énergie a été définitivement arrêtée le 17 avril 2020 après 19 journées, annulant la tenue des playoffs. Tenant du titre, Metz Handball a terminé premier du classement à égalité de points avec le Brest Bretagne Handball. En raison des circonstances sanitaires, la fédération a fait le choix de ne pas attribuer le titre de champion de France, mais a validé la qualification des Messines pour la prochaine campagne européenne. En Coupe de France, la compétition à élimination directe a quant à elle été purement et simplement annulée par la Fédération française de handball le 24 mars 2020. En Ligue des Champions, les Dragonnes ont pourtant livré une phase de poules exceptionnelle en terminant à la 1re place de leur groupe du tour principal, devant des cadors comme Esbjerg et Rostov. Alors que l'équipe s'était qualifiée pour les quarts de finale, la compétition européenne a d'abord été suspendue avant d'être définitivement annulée par l'EHF le 26 juin 2020, privant le groupe d'Emmanuel Mayonnade d'une opportunité de disputer un nouveau Final Four.